Ya he colocado mejor los condensadores, o al menos eso creo. He puesto el de filtrado de la alimentación del 555 cerca de sus patillas 1 y 8, luego los dos del estabilizador, el de entrada próximo a las clemas y el de salida cerca del estabilizador. El que me ha quedado un poco lejos es el de control del 555, pero bueno. Además he reducido la longitud de las pistas de potencia (que reforzaré con estaño para aumentar su sección), en conjunto creo que la disposición es adecuada.
Este es el esquema eléctrico:
Esta es la PCB vista desde el lado de los componentes:

Y esta es la PCB vista desde el lado de las pistas, para su mecanizado:
Las dimensiones de la placa a penas han variado, ahora son de 30,5x45mm, a pesar de haber añadido el regulador. Además adjunto los documentos en formato EAGLE y el G-code necesario para su fabricación mediante fresado CNC.
Un saludo.